Projekte

Der schnell voranschreitende Klimawandel in den Schweizer Alpen treibt den Gletscherschwund an und taut Permafrost auf. Wir erforschen die Auswirkungen dieser drastischen Veränderungen auf die alpine Biodiversität.

Wir erforschen Gletscher als Refugium für mikrobielle Lebensformen in den Schweizer Alpen. Diese Organismen leben Tausende von Jahren im Eis und kommen nun durch die Klimaerwärmung wieder zum Vorschein.

We explore permafrost as a refuge for microbial life forms in the three poles (Alps, Arctic, Antarctic). These organisms live in permafrost and ice for thousands of years.

Erprobung der Kosteneffizienz von Indikatoren für die biologische Vielfalt des Bodens und der Bereitstellung von Ökosystemleistungen auf der Grundlage der biologischen Vielfalt des Bodens, um bessere Lösungen für die Landbewirtschaftung zu entwickeln, die die EU-Bodenstrategie wirksam umsetzen.

Langfristige Klimaexperimente zur Untersuchung der Reaktionen des alpinen Bodenmikrobioms und Bodenfunktionen auf den Klimawandel.

Die weltweite Plastikverschmutzung ist zu einem dringenden Problem geworden, das die Umwelt und das menschliche Wohlergehen bedroht. Selbst sehr abgelegene Regionen in der Arktis und in den Alpen sind mit Mikroplastik verschmutzt. Plastik abbauende Mikroorganismen und ihre Enzyme könnten dazu beitragen, das Plastikrecycling nachhaltiger zu gestalten.

Die kalten Lebensräume unserer Schweizer Alpen und der Arktis befinden sich in einem Wandel und drohen zukünftig ganz oder teilweise zu verschwinden. Mit ihnen verschwinden auch eine noch kaum erforschte Vielfalt an Mikroorganismen, die sich ans Leben an vermeintlich lebensfeindlichen Orten angepasst haben. Durch die Kryokonservation von Mikroorganismen ebendieser Lebensräume kann ein Teil der heutigen Biodiversität in Biobanken erhalten bleiben.

Publikationen

Cuartero J., Briones M.J.I., Rast B.M., Stierli B., Maurer-Troxler C., Hug A.S., … Frey B. (2025) Earthworm and enchytraeid indicator taxa of different land-use types identified using soil DNA metabarcoding. Appl. Soil Ecol. 206, 105891 (16 pp.). doi:10.1016/j.apsoil.2025.105891 Institutional Repository DORA

Feng M., Robinson S., Qi W., Edwards A., Stierli B., van der Heijden M., … Varliero G. (2024) Microbial genetic potential differs among cryospheric habitats of the Damma glacier. Microb. Genom. 10(10), 001301 (17 pp.). doi:10.1099/mgen.0.001301 Institutional Repository DORA

Frey B., Aiesi M., Rast B.M., Rüthi J., Julmi J., Stierli B., … Brunner I. (2024) Searching for new plastic-degrading enzymes from the plastisphere of alpine soils using a metagenomic mining approach. PLoS One. 19(4), e0300503 (23 pp.). doi:10.1371/journal.pone.0300503 Institutional Repository DORA

Varliero G., Frossard A., Qi W., Stierli B., Frey B. (2024) Metatranscriptomic responses of High-Arctic tundra soil microbiomes to carbon input. Soil Biol. Biochem. 197, 109539 (16 pp.). doi:10.1016/j.soilbio.2024.109539 Institutional Repository DORA

Feng M., Varliero G., Qi W., Stierli B., Edwards A., Robinson S., … Frey B. (2023) Microbial dynamics in soils of the Damma glacier forefield show succession in the functional genetic potential. Environ. Microbiol. 25(12), 3116-3138. doi:10.1111/1462-2920.16497 Institutional Repository DORA

Han X., Beck K., Bürgmann H., Frey B., Stierli B., Frossard A. (2023) Synthetic oligonucleotides as quantitative PCR standards for quantifying microbial genes. Front. Microbiol. 14, 1279041 (11 pp.). doi:10.3389/fmicb.2023.1279041 Institutional Repository DORA

Hartmann M., Herzog C., Brunner I., Stierli B., Meyer F., Buchmann N., Frey B. (2023) Long-term mitigation of drought changes the functional potential and life-strategies of the forest soil microbiome involved in organic matter decomposition. Front. Microbiol. 14, 1267270 (16 pp.). doi:10.3389/fmicb.2023.1267270 Institutional Repository DORA

Rüthi J., Cerri M., Brunner I., Stierli B., Sander M., Frey B. (2023) Discovery of plastic-degrading microbial strains isolated from the alpine and Arctic terrestrial plastisphere. Front. Microbiol. 14, 1178474 (16 pp.). doi:10.3389/fmicb.2023.1178474 Institutional Repository DORA

Sannino C., Qi W., Rüthi J., Stierli B., Frey B. (2023) Distinct taxonomic and functional profiles of high Arctic and alpine permafrost-affected soil microbiomes. Environ. Microbiome. 18(1), 54 (22 pp.). doi:10.1186/s40793-023-00509-6 Institutional Repository DORA

Zhang Y.L., Yang Y., Saurer M., Schaub M., Gessler A., Lehmann M.M., … Li M.H. (2023) Sugar infusion into trees: a novel method to study tree carbon relations and its regulations. Front. Plant Sci. 14, 1142595 (11 pp.). doi:10.3389/fpls.2023.1142595 Institutional Repository DORA

Frey B., Rast B.M., Qi W., Stierli B., Brunner I. (2022) Long-term mercury contamination does not affect the microbial gene potential for C and N cycling in soils but enhances detoxification gene abundance. Front. Microbiol. 13, 1034138 (18 pp.). doi:10.3389/fmicb.2022.1034138 Institutional Repository DORA

Frey B., Varliero G., Qi W., Stierli B., Walthert L., Brunner I. (2022) Shotgun metagenomics of deep forest soil layers show evidence of altered microbial genetic potential for biogeochemical cycling. Front. Microbiol. 13, 828977 (18 pp.). doi:10.3389/fmicb.2022.828977 Institutional Repository DORA

Perez-Mon C., Stierli B., Plötze M., Frey B. (2022) Fast and persistent responses of alpine permafrost microbial communities to in situ warming. Sci. Total Environ. 807, 150720 (15 pp.). doi:10.1016/j.scitotenv.2021.150720 Institutional Repository DORA

Frey B., Walthert L., Perez-Mon C., Stierli B., Köchli R., Dharmarajah A., Brunner I. (2021) Deep soil layers of drought-exposed forests harbor poorly known bacterial and fungal communities. Front. Microbiol. 12, 674160 (21 pp.). doi:10.3389/fmicb.2021.674160 Institutional Repository DORA

Walser M., Schneider Mathis D., Köchli R., Stierli B., Maeder M., Brunner I. (2021) Der Waldboden lebt - Vielfalt und Funktion der Bodenlebewesen. Merkblatt für die Praxis: Vol. 60. (2nd ed.). Birmensdorf: Eidg. Forschungsanstalt WSL. 12 p. Institutional Repository DORA

Walser M., Schneider Mathis D., Köchli R., Stierli B., Maeder M., Brunner I. (2021) Le sol forestier vit - diversité et fonctions des organismes vivants du sol. Notice pour le praticien: Vol. 60. (2nd ed.). Birmensdorf: Institut fédéral de recherches WSL. 12 p. Institutional Repository DORA

Herzog C., Hartmann M., Frey B., Stierli B., Rumpel C., Buchmann N., Brunner I. (2019) Microbial succession on decomposing root litter in a drought-prone Scots pine forest. ISME J. 13(9), 2346-2362. doi:10.1038/s41396-019-0436-6 Institutional Repository DORA

Brunner I., Fischer M., Rüthi J., Stierli B., Frey B. (2018) Ability of fungi isolated from plastic debris floating in the shoreline of a lake to degrade plastics. PLoS One. 13(8), e0202047 (14 pp.). doi:10.1371/journal.pone.0202047 Institutional Repository DORA

Walser M., Schneider Mathis D., Köchli R., Stierli B., Maeder M., Brunner I. (2018) Der Waldboden lebt – Vielfalt und Funktion der Bodenlebewesen. Merkblatt für die Praxis: Vol. 60. Birmensdorf: Eidg. Forschungsanstalt WSL. 12 p. Institutional Repository DORA

Walser M., Schneider Mathis D., Köchli R., Stierli B., Maeder M., Brunner I. (2018) Le sol forestier vit – diversité et fonctions des organismes vivants du sol. Notice pour le praticien: Vol. 60. Birmensdorf: Institut fédéral de recherches WSL. 12 p. Institutional Repository DORA

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