20.06.2019 | Beate Kittl | News WSL
In un contesto caratterizzato dai cambiamenti climatici, l'abete bianco è una specie arborea importante. Per poterla studiare in maniera più approfondita, un team internazionale con la partecipazione dell'Istituto Federale di ricerca WSL ha decodificato il vasto patrimonio genetico di un abete bianco di Zurigo.
Su un abete poco appariscente del bosco di Rameren (Birmensdorf ZH) compare la scritta in blu «AA_WSL01». È dai suoi semi e dai suoi aghi che proviene il DNA del primo genoma decodificato di abete bianco, vale a dire il patrimonio ereditario completo. Il nostro abete autoctono è solo la sesta specie di conifere al mondo la cui sequenza genomica è nota, il che non è cosa da poco, dal momento che le conifere possiedono un enorme patrimonio genetico con molti segmenti di DNA che si ripetono. Ciò ha reso il sequenziamento un'impresa da titani, possibile solamente grazie alla collaborazione internazionale. Il team di ricerca ha decodificato nel complesso 18 miliardi di coppie di basi, i singoli tasselli che compongono il patrimonio ereditario. Si tratta di una cifra sei volte superiore a quella delle coppie di basi presenti nel genoma umano.
«È come un gigantesco puzzle che si deve comporre senza modello», spiega il coautore del WSL Felix Gugerli, che insieme al suo team rappresenta il lato svizzero del consorzio internazionale. «Adesso disponiamo di un'immagine complessiva, seppur ancora sfuocata, del genoma dell'abete bianco». I componenti del patrimonio ereditario che contengono geni, ovvero le informazioni genetiche per la produzione di proteine con determinate funzioni, sono ben descritti. Nel mezzo si trovano in gran parte sequenze ripetitive di coppie di basi. Per comporre un quadro complessivo a partire da questi tasselli i ricercatori hanno ancora molto lavoro da compiere.
L'abete giusto al posto giusto ¶
Lo sforzo viene premiato, in quanto un genoma decodificato contribuisce a comprendere la diversità genetica all'interno della specie, utile ad esempio per scoprire quali alberi crescono meglio in un determinato sito. Inoltre, i coltivatori di alberi di Natale hanno interesse a scegliere gli alberi con le caratteristiche desiderate, come una lunga durata degli aghi. Osservando i geni è possibile riconoscere le caratteristiche già nelle giovani piante, senza dovere aspettare che crescano per alcuni anni. Ciò è nettamente più rapido che con i complessi esperimenti sulle piante.
A partire dal XVIII secolo l'abete bianco è diventato l'albero di Natale per eccellenza e lo è rimasto fino a quando non è stato soppiantato dall'abete del Caucaso. A seguito dei cambiamenti climatici, questa specie assume oggi una crescente importanza in selvicoltura come sostituto di abeti rossi e faggi, rilevanti sotto il profilo economico. Si prevede in effetti che, in un clima più caldo e asciutto, essi si sviluppino meno degli abeti bianchi. Al contrario, finora questi ultimi erano svantaggiati in quanto i caprioli sono particolarmente ghiotti dei loro germogli. Dal momento che in mancanza di predatori naturali le popolazioni di caprioli sono in notevole aumento, spesso gli alberi vengono protetti da recinzioni o involucri di plastica.
Le analisi del patrimonio ereditario consentono ai selvicoltori di selezionare gli alberi più idonei al luogo, rendendo più redditizia la costosa e complessa coltivazione degli abeti bianchi. Per questo la decodificazione dell'enorme genoma dell'abete bianco è un investimento per una specie importante e dunque anche per un'economia forestale sostenibile.
Contatto ¶
Links e documenti ¶
Pubblicazione originale:
Mosca E, Cruz F, Gómez Garrido J, Bianco L, Rellstab C, Bazin E, Brodbeck S, Csilléry K, Fady B, Fladung M, Fussi B, Gömöry D, González-Martínez SC, Grivet D, Gut M, Hansen OK, Heer K, Kaya Z, Krutovsky KV, Kersten B, Liepelt S, Opgenoorth L, Sperisen C, Ullrich KK, Vendramin GG, Westergren M, Ziegenhagen B, Alioto T, Gugerli F, Heinze B, Höhn M, Troggio M, Neale DB 2019. A reference genome sequence for the European silver fir (Abies alba Mill.): a community resource in support of climate change research. G3—Genes, Genomes, Genetics doi: https://doi.org/10.1534/g3.119.400083
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